Alen Sajko rođen je 19. rujna 1969. u Varaždinu. Osnovnu školu završio je u Bednji, a srednju školu „Nikola Tesla” u Zagrebu 1988. godine. Nakon odsluženja vojnog roka upisao je smjer fizike na Prirodoslovno-matematičkom fakultetu Sveučilišta u Zagrebu, gdje je diplomirao 1996. godine na usmjerenju meteorologija s temom Mlazna struja na području sjeverozapadne Hrvatske.

Od 1996. godine bio je zaposlen u Sektoru zrakoplovne meteorologije Hrvatske kontrole zračne plovidbe. Najveći dio karijere radio je na operativnim poslovima kao oblasni prognostičar, a povremeno je obavljao i razvojne poslove vizualizacije meteoroloških produkata, programiranja, izrade baza podataka i zrakoplovne klimatologije. Od 2012. bio je direktor Sektora zrakoplovne meteorologije.

Od 2007. do 2014. godine pohađao je više razina školovanja za pilotsku dozvolu i stekao dozvolu profesionalnog pilota aviona s više ovlaštenja, od kojih su najvažnija ovlaštenja za instrumentalno letenje na jednomotornim i višemotornim avionima. Povremeno je radio kao predavač zrakoplovne meteorologije u pilotskim školama i zrakoplovnim kompanijama.

Od 2001. do 2013. godine radio je na raznim poslovima u lokalnoj i regionalnoj samoupravi: obnašao je dužnost zamjenika načelnika Općine Bednja, bio je vijećnik u skupštini Varaždinske županije te obnašao dužnost predsjednika Turističke zajednice Trakošćan – Općina Bednja i Turističke zajednice Sjeverno zagorje.

Aktivno je sudjelovao u radu međunarodnih organizacija i radnih grupa koje se bave zrakoplovnom meteorologijom (EUMETNET-AVIMET, ICAO, WMO) te je bio intenzivno uključen u međunarodne aktivnosti Hrvatske kontrole zračne plovidbe na korporativnoj razini. Aktivno je pratio sva zbivanja u vezi s inicijativom Single European Sky (SES) Europske komisije. Od 2014. sudjelovao je u procesima ulaska Hrvatske kontrole zračne plovidbe u europski program razvoja pružatelja usluga u zračnoj plovidbi pod nazivom SESAR (Single European Sky ATM Research).

U HMD-u je bio aktivan od 2001. obnašajući dužnost člana upravnog i nadzornog odbora u više mandata, a predsjednik je bio od 2013. do 2017. godine.

Alen Sajko umro je 2023. godine.