Antun Marki rođen je 10. prosinca 1964. godine u Subotici (Vojvodina, Srbija), gdje je pohađao i završio osnovnu i srednju školu. Prirodoslovno-matematički fakultet u Zagrebu upisao je 1984. godine na inženjerskom smjeru fizike, a 1986. smjer Geofizika s meteorologijom. Diplomirao je 1990., a doktorirao 1999. s tezom Modeliranje srednjeg dnevnog hoda komponenata dozračene Sunčeve energije. Na Geofizičkom odsjeku PMF-a zaposlen je od 1991., gdje radi i danas u svojstvu višeg predavača. Održava nastavu na prijediplomskom i diplomskom studiju geofizike na kojem je pod njegovim (ko)mentorstvom diplomiralo 30-ak studenata. Voditelj je terenske nastave na prijediplomskom i diplomskom studiju geofizike. Sudjelovao je na desetak domaćih projekata resornog ministarstva RH, odnosno Hrvatske zaklade za znanost.

Na znanstvenom polju bavi se proučavanjem prizemnog sloja atmosfere (diplomski rad), ozonom, polarnom svjetlošću, vjetrom na Jadranu, geomagnetizmom u Hrvatskoj, a najvećim dijelom Sunčevim zračenjem (doktorat).

Član je Hrvatskog meteorološkog društva od 1991., u kojem je obavljao i još uvijek obavlja razne dužnosti, od člana upravnog odbora preko člana ili predsjednika nadzornog odbora do predsjednika HMD-a. Od 1999. bio je član nekoliko uređivačkih odbora Hrvatskog meteorološkog časopisa, a od 2001. do 2011. pomoćnik glavnog urednika.

Od osnutka 2012. godine član je Hrvatskog agrometeorološkog društva, aktivan kao član ili predsjednik nadzornog odbora, a od 2020. njegov dopredsjednik već u drugom mandatu.

Od 2010. obavlja i dužnost tehničkog urednika časopisa Geofizika, koji izdaje Geofizički zavod Andrija Mohorovičić PMF-a.